माप्पिला मुसलमान शुरू में एक व्यापारिक समुदाय के रूप में मलबार में बस गए थे, उन्होंने राजनीतिक महत्वाकांक्षाओं के बिना पूरी तरह से अपने व्यापार पर ध्यान केंद्रित किया था। उन्होंने स्थानीय शासकों को व्यापारिक गतिविधियों के माध्यम से अपनी संपत्ति बढ़ाने में सहायता करने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाई। बदले में, शासक अपनी व्यावसायिक समृद्धि के लिए अरबों और मुसलमानों पर निर्भर थे। धार्मिक विश्वासों में मतभेदों के बावजूद, माप्पिला और स्थानीय शासकों के बीच सौहार्दपूर्ण संबंध थे, वे एक-दूसरे के रीति-रिवाजों और अनुष्ठानों का परस्पर सम्मान करते थे; शासकों ने माप्पिला की रक्षा की, उन्हें अपनी मान्यताओं और परंपराओं का पालन करने की स्वतंत्रता दी। अरबों और अन्य विदेशियों के साथ संबंध बनाए रखने के शासकों के उदाहरण का अनुसरण करते हुए, स्थानीय आबादी का एक महत्वपूर्ण हिस्सा अरब धर्म में परिवर्तित हो गया, जिससे अपनी अलग पहचान वाले एक संकर समुदाय का निर्माण हुआ।
यात्रियों और इतिहासकारों के ऐतिहासिक विवरण माप्पिला और स्थानीय शासकों के बीच शांतिपूर्ण संबंधों को उजागर करते हैं। हालाँकि, मैसूरी मुस्लिम आक्रमण के दौरान मलबार में राजनीतिक अशांति की एक संक्षिप्त अवधि उभरी, जब मैसूरी सेना ने ज़मोरिन को हराया। धार्मिक संबंधों के बावजूद, अधिकांश माप्पिला ने मैसूरी आक्रमणकारियों का विरोध करने के लिए ज़मोरिन का साथ दिया, जिससे धार्मिक निष्ठा से ज़्यादा स्थानीय शासकों के प्रति उनकी वफ़ादारी का प्रदर्शन हुआ। इसके अतिरिक्त, अरक्कल राजवंश के तहत कण्णूर में एक छोटा लेकिन महत्वपूर्ण मुस्लिम साम्राज्य पनपा, जहाँ सुल्तान और बीवी ने लंबे समय तक स्थानीय नेताओं के रूप में शासन किया।
पुर्तगालियों और अन्य औपनिवेशिक शक्तियों के आगमन ने मलबार में अरब व्यापार के प्रभुत्व में गिरावट का संकेत दिया, जिससे क्षेत्र की समृद्धि पर बहुत असर पड़ा। जवाब में, ज़मोरिन ने माप्पिला नौसेना बलों के समर्थन से पुर्तगालियों का विरोध करने के लिए निर्णायक कदम उठाए। ज़मोरिन के नौसैनिक कमांडरों के रूप में प्रसिद्ध मरक्कारों के नेतृत्व में, इस बल ने औपनिवेशिक आक्रमण को रोकने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाई। मरक्कारों ने अपने नेतृत्व और महत्वपूर्ण योगदान के लिए 'कुन्जाली मरक्कार' की उपाधि अर्जित की।
केरल उपनिवेशवाद विरोधी प्रतिरोध का एक प्रमुख केंद्र बनकर उभरा, जहाँ अक्सर मुसलमान इन संघर्षों का नेतृत्व करते थे। शेख ज़ैनुद्दीन और शेख मामुक्कोया जैसे सूफी नेताओं ने वैचारिक मार्गदर्शन दिया, इस बात पर ज़ोर दिया कि आक्रमणकारियों का विरोध करना और न्यायप्रिय शासकों की रक्षा करना मुसलमानों का धार्मिक कर्तव्य है, बशर्ते शासक अपनी प्रजा के कल्याण की परवाह करें। यह प्रतिरोध एक सदी से भी ज़्यादा समय तक चला, यहाँ तक कि पुर्तगालियों द्वारा अपनी राजधानी मलबार के उत्तर में गोवा में स्थानांतरित करने के बाद भी जारी रहा।
1757 में, हैदर अली के नेतृत्व में मैसूर साम्राज्य ने स्थानीय सरदारों के बीच आंतरिक संघर्षों का लाभ उठाते हुए मलबार में अपना प्रभाव बढ़ाया। हैदर अली ने मलबार को एक प्रांत में एकीकृत किया और अपने बेटे टीपू सुल्तान के साथ मिलकर उन्होंने न केवल ब्रिटिश सेनाओं का विरोध किया, बल्कि एक समान राजस्व प्रणाली और पूरे प्रांत में सड़कों के नेटवर्क के विकास सहित प्रमुख प्रशासनिक सुधार भी किए।
हैदर अली और टीपू सुल्तान ने किसान-केंद्रित भूमि सुधार भी पेश किए, जिससे जमींदारों की शक्ति कम हुई और किसानों के लाभ के लिए भूमि का पुनर्वितरण हुआ। इसके अतिरिक्त, टीपू सुल्तान ने बहुपति प्रथा को समाप्त करने का प्रयास किया, जो उस समय मलबार में व्यापक थी, इसे एक सामाजिक बुराई के रूप में देखते हुए, जिसके परिणामस्वरूप नाजायज बच्चे पैदा होते थे, जिन्हें अपने पैतृक वंश के बारे में पता नहीं होता था। इन सुधारों ने केरल के इतिहास में सुधारवादी युग की शुरुआत का संकेत दिया।