1792 में, टीपू सुल्तान के पतन के साथ, ब्रिटिश सेना ने मलबार पर कब्ज़ा कर लिया और उसके द्वारा शुरू किए गए सुधारों को तुरंत वापस ले लिया। उन्होंने पुरानी जमींदारी व्यवस्था को पुनर्जीवित किया, स्थानीय जमींदारों को असंगत शक्ति सौंप दी। औपनिवेशिक प्रशासन के समर्थन से, इन जमींदारों ने माप्पिला मुसलमानों पर लगातार अत्याचार किए। ब्रिटिश शासन के तहत जीवन लगातार कठोर होता गया, और अन्याय के बोझ ने अंततः किसान विद्रोह की लहर को जन्म दिया जो 19वीं और 20वीं सदी में फैल गया।
माप्पिला मुसलमान, जो पहले से ही ब्रिटिश नीतियों से निराश थे - खासकर तुर्की के खलीफा, वैश्विक मुस्लिम समुदाय के आध्यात्मिक प्रमुख के साथ उनके कथित विश्वासघात से - खिलाफत आंदोलन में नया उद्देश्य मिला। मौलाना मुहम्मद अली और उनके भाई शौकत अली जैसे मुस्लिम नेताओं के साथ महात्मा गांधी द्वारा संचालित इस आंदोलन ने भारतीय मुसलमानों की चिंताओं को भारत के राष्ट्रीय स्वतंत्रता के व्यापक संघर्ष से जोड़ा। गांधी की मलबार यात्रा महत्वपूर्ण साबित हुई, स्थानीय समर्थन को बढ़ावा मिला और पूरे क्षेत्र में खिलाफत समितियों के गठन का मार्ग प्रशस्त हुआ, जिससे आंदोलन के आदर्श मलबार के राजनीतिक परिदृश्य में गहराई से समा गए।
शोषक जमींदारों के खिलाफ प्रतिरोध के अपने लंबे इतिहास के साथ, मलबार स्वाभाविक रूप से खिलाफत आंदोलन का गढ़ बनकर उभरा और इसके सबसे सक्रिय और अस्थिर मोर्चों में से एक बन गया।
आली मुसलियार और वारियन कुन्नत्त कुन्जहम्मद हाजी जैसे नेताओं ने मलबार में एक अल्पकालिक खिलाफत शासन की स्थापना की, जो लगभग छह महीने तक चला। अपने संक्षिप्त अस्तित्व के बावजूद, यह आंदोलन औपनिवेशिक वर्चस्व और सामंती शोषण दोनों के खिलाफ विद्रोह का एक शक्तिशाली प्रतीक बन गया, जो इस क्षेत्र की प्रतिरोध की गहरी भावना को दर्शाता है।
अंग्रेजों ने विद्रोह का क्रूर दमन किया, जिससे माप्पिला समुदाय पर व्यापक पीड़ा हुई। अनगिनत लोगों को कैद किया गया, उन पर झूठे आरोप लगाए गए, उन्हें दूर-दराज के इलाकों में निर्वासित किया गया और उन्हें लगातार परेशान किया गया और उन पर निगरानी रखी गई। कांग्रेस पार्टी की उनके संघर्षों के प्रति उदासीनता से निराश होकर, कई माप्पिला लोगों ने राष्ट्रीय आंदोलन से खुद को दूर करना शुरू कर दिया और धीरे-धीरे मुस्लिम लीग के साथ जुड़ गए, जिससे क्षेत्र में उनकी उपस्थिति और राजनीतिक प्रभाव में काफी वृद्धि हुई।
