تعكس العمارة الفريدة لمساجد مابيلا كما كتب ر.إ. ميلر، ليس فقط اندماج مجتمع مابيلا في الثقافة الكيرالية ولكن أيضًا عزلته عن الإسلام الهندي. بدلاً من اتباع النمط المغولي، تتبع مساجد مابيلا نمط المعمار الجايني المحلي. تشبه المساجد المعابد الهندوسية في جميع النواحي باستثناء الداخل، حيث يتم ترتيب محراب الصلاة والمنبر بالطريقة الإسلامية.
من الواضح تاريخيًا أن المساجد الأولى قد بُنيت على يد نجارين وبنائين هندوس الذين اتبعوا أسلوب الفن الهندوسي. ولهذا السبب، يمكن العثور في بعض المساجد القديمة على رموز من الأساطير الهندوسية مثل التريسول، المنحوتة أمام الجملون. وكان هناك أيضًا ممارسة تقديم المنح من قبل الزامورين للحفاظ على المساجد. وتوجد الكتابة التي توثق واحدة من منح الأراضي في مسجد موشونتي في كاليكوت. وقد أُقيمت المعابد والمساجد جنبًا إلى جنب، مما حافظ على التناغم بين المسلمين والهندوس.