ومع ذلك، في عام 1792، هزم البريطانيون تيبو سلطان وفرضوا السيطرة على مالابار، مما أدى إلى عكس سياساته التقدمية. أعادوا نظام الإقطاع، مما منح قوة مفرطة للإقطاعيين. وفي ظل الحكم البريطاني، واجه مسلمو المابيلا صعوبات شديدة، خاصة بسبب الممارسات القمعية من الإقطاعيين المدعومين من الإدارة الاستعمارية. أدت هذه الظروف القمعية إلى انتشار صراعات الفلاحين خلال القرنين التاسع عشر والعشرين.
كان مسلمو المابيلا، الذين كانوا بالفعل غير راضين عن السياسات البريطانية - وخاصة مؤامراتها ضد الخليفة التركي، الزعيم الروحي للعالم الإسلامي - قد جُذِبوا إلى حركة الحرية الوطنية الهندية من خلال حركة الخلافة. وكانت هذه المبادرة قد قادها المهاتما غاندي وزعماء مسلمون مثل مولانا محمد علي وأخيه شوكت علي. فلقد لعبت زيارة غاندي إلى مالابار دورًا محوريًا في تعزيز مبادئ حركة الخلافة، مما أسفر عن إنشاء لجان الخلافة في جميع أنحاء المنطقة.
مالابار، التي كانت منذ زمن طويل مركزاً للتمرد ضد الملاك الظالمين، أصبحت محوراً لكفاح الخلافة.
أقام قادة مثل علي مسليار وفاريان كوناث كونجهاماد هاجي حكم الخلافة لفترة قصيرة في مالابار، واستمر لحوالي ستة أشهر. فعلى الرغم من قصره، إلا أنه شكل تأكيدًا كبيرًا على المقاومة المحلية ضد الاستعمار والاضطهاد الإقطاعي.
ومع ذلك، قامت القوات البريطانية بقمع الثورة بوحشية، مما أدى إلى تزايد الأعباء على مجتمع المابيلا. تم سجن العديد منهم، ووجهت إليهم اتهامات زائفة، وتم نفيهم إلى مناطق نائية، وتعرضوا لمضايقات متواصلة. ومع خيبة أملهم من المؤتمر الوطني الذي بدا غير مبالٍ بمعاناتهم، قام العديد من المابيلا بتحويل ولائهم السياسي إلى الرابطة الإسلامية، مما عزز تأثيرها في المنطقة.
