20 सितंबर, 1928 (मलयालम कैलेंडर में कन्नी 5) को, श्री नारायण गुरु ने अपने कमरे में आए एक शिष्य से धीरे से बात की। उन्होंने कहा कि राहु ने उन्हें ग्रहण लगा दिया है और जाने का समय आ गया है। उस दोपहर बाद, उन्होंने खुद बैठने की कोशिश की। उन्होंने शांति से कहा कि उन्हें उठना होगा, क्योंकि उन्हें गहरी शांति महसूस हो रही थी। मदद से, उन्हें पालथी मारकर बैठने की मुद्रा में लाया गया। उस समय, श्री विद्यानंद स्वामी पास ही बैठे थे। वे योग वशिष्ठ से जीवनमुक्ति प्रकरणम पढ़ रहे थे। जैसे ही मुक्ति पाने के बारे में बताने वाला हिस्सा ज़ोर से पढ़ा गया, गुरु गहरे ध्यान में चले गए। उस ध्यान की अवस्था में, उन्होंने धीरे से अपना शरीर छोड़ा और समाधि ले ली। शिवगिरी में श्री नारायण मठ से, मंदिर की घंटियाँ लगातार बज रही थीं। बजने की आवाज़ ने दुनिया को गुरु की समाधि की घोषणा कर दी। इसके तुरंत बाद, बड़ी संख्या में लोग शिवगिरी मठ में आने लगे।
आज, शिवगिरी पूजा का एक पवित्र केंद्र है और दुनिया भर में इसका बहुत महत्व है। शिवगिरी पहाड़ी पर, जहाँ श्री नारायण गुरु के शरीर को दफनाया गया था, भक्तों ने बाद में एक बड़ा महासमाधि मंडप बनाया। हर दिन, कई देशों से लोग शिवगिरी आते हैं। वे महासमाधि और शारदा मठ में पूजा करने आते हैं।
अपने जीवनकाल में, श्री नारायण गुरु को साथी आध्यात्मिक गुरुओं से बहुत पहचान और गहरा सम्मान मिला। लोग उनकी गहरी आध्यात्मिक शक्ति को पहचानकर, अपनी निजी और सामाजिक समस्याएं उनके सामने रखते थे। गुरु ने सिर्फ़ जवाब ही नहीं दिए। उन्होंने ऐसे साफ़ रास्ते दिखाए जिनसे लोग जाग सकें और अपनी ज़िंदगी बदल सकें। इंसानियत से दूर होते जा रहे मानवीय मूल्यों को फिर से बसाना उनके सभी विचारों, शब्दों और कामों का मुख्य मकसद था। गुरु से जो निकलता था वह कोई सख्त धार्मिक आज्ञा नहीं थी। इसके बजाय, उन्होंने उन बुराइयों को दूर करने के तरीके बताए जो धर्म ने खुद इंसानी ज़िंदगी पर थोपी थीं। उन्होंने हमेशा एक नैतिक रूप से बेहतर और दयालु इंसान के आदर्श को बनाए रखा। गुरु एक समाज सुधारक थे। वे एक अद्वैतवादी थे। वे एक आध्यात्मिक गुरु और कवि थे। सामाजिक बुराइयों के खिलाफ़ उन्होंने जो आसान और निडर रास्ता दिखाया, उससे उन्हें अपने जीवनकाल में भी बहुत सम्मान मिला। इस हमेशा रहने वाले असर ने उन्हें बीसवीं सदी की सबसे महान हस्तियों में से एक के तौर पर मज़बूती से स्थापित किया।
