सहोदरन अय्यप्पन एक पक्के समाज सुधारक थे जिन्होंने अपनी ज़िंदगी जाति के भेदभाव से लड़ने में लगा दी। चेराई गौरीश्वर मंदिर की प्राण-प्रतिष्ठा में श्री नारायण गुरु से मिलने के बाद उनका कमिटमेंट और गहरा हो गया। इस मुलाकात के बाद, अय्यप्पन ने समाज सुधार पर अपना ध्यान लगाया। उनका ज़्यादातर काम गुरु के आदर्शों को फैलाने और उन पर अमल करने के मकसद से था।
सहोदरन अय्यप्पन ने चार साल तक श्री नारायण धर्म परिपालन योगम के प्रेसिडेंट के तौर पर काम किया। उन्होंने कोच्चि और त्रावणकोर-कोचीन में लेजिस्लेटिव असेंबली के मेंबर के तौर पर भी काम किया। उनका मानना था कि नेकी बनाए रखना इंसानियत का सबसे बड़ा फ़र्ज़ है। अय्यप्पन एक ज़बरदस्त वक्ता थे। उनके भाषणों में ज़रूरतमंद समुदायों से सामाजिक बुराइयों और बेतुकी मान्यताओं को ठुकराने की अपील की जाती थी। वह जाति के भेदभाव को अवैज्ञानिक और नुकसानदायक मानते थे। उन्होंने साइंटिफिक तर्क का इस्तेमाल करके अंधविश्वासों और रीति-रिवाजों को चुनौती दी। अय्यप्पन को लगता था कि ईष़वाओं के लिए असली बराबरी सामाजिक तौर पर घुलने-मिलने में है। उनका मानना था कि इसका मतलब जाति के क्रम में नीचे माने जाने वालों के साथ खड़ा होना है। इस विचार को अमल में लाने के लिए, उन्होंने निचली जाति के लोगों के साथ मिश्राभोजनम (मिल-जुलकर खाना) शुरू किया। इस हिम्मत वाले काम से कंज़र्वेटिव ईष़वा नाराज़ हो गए। उन्होंने मज़ाक में उनका नाम “पुलायन अय्यप्पन” रखा। इसी आंदोलन से सहोदर संघम (भाईचारा संगठन) बना।
मिश्राभोजनम के कड़े विरोध के बावजूद, सहोदरन अय्यप्पन को श्री नारायण गुरु से पूरा सपोर्ट मिला। गुरु ने सहोदर संघम को एक मैसेज भेजा जिसमें कहा गया था कि आपस में खाना-पीना और आपस में शादी करना ठीक है। उन्होंने कहा कि सभी इंसान एक ही जाति के हैं। ये शब्द जाति के भेदभाव के खिलाफ एक मज़बूत ऐलान बन गए। अय्यप्पन ने मैसेज की प्रिंटेड कॉपी बड़े पैमाने पर बांटीं। बाद में, उन्होंने अपने विचारों को और फैलाने के लिए सहोदरन अखबार शुरू किया। इस कोशिश से, वे सहोदरन अय्यप्पन के नाम से मशहूर हुए।
श्री नारायण गुरु मंदिर को समाज में बदलाव लाने का एक ज़रिया मानते थे। उनका मानना था कि धर्म, असल में, इंसानियत को जोड़ सकता है। लेकिन, सहोदरन अय्यप्पन मंदिर को अलग नज़रिए से देखते थे। वे इसे एक ऐसी संस्था मानते थे जो कमर्शियल मकसद के लिए धर्म का फ़ायदा उठाती थी। उनका मशहूर तर्क था कि कोई भी धर्म जो इंसानों को बांटता है, ज़रूरी नहीं है। इन अलग-अलग नज़रियों के बावजूद, उनका बुनियादी नज़रिया एक ही था। दोनों इंसानी एकता और सामाजिक बराबरी चाहते थे। अय्यप्पन ने हिंदू धर्म में अंधविश्वास और बिना सोचे-समझे कामों का कड़ा विरोध किया। इस विरोध ने उनकी कविता को ताकत और तेज़ी दी। उन्होंने कई पॉपुलर और प्रेरणा देने वाली कविताएँ लिखीं। उनकी रचनाएँ प्रोग्रेसिव लिटरेरी मूवमेंट से भी पहले सामने आईं। उनके लिए साहित्यिक सुंदरता से ज़्यादा सोच का प्रचार-प्रसार मायने रखता था। गुरु और उनके शिष्य दोनों ने अलग-अलग धर्मों के बीच झगड़े के मुद्दे पर बात की। गुरु का मकसद धर्मों के बीच मेल-मिलाप कराना था। अय्यप्पन का मानना था कि हमेशा रहने वाली शांति के लिए धर्म को पूरी तरह से नकारना ज़रूरी है।
